U nastavku su dostupne upute za rad u e-Matici. U uputama, koje su podijeljene u nekoliko kategorija, detaljno su opisani svi koraci koje je potrebno napraviti za pojedine akcije u e-Matici. Uz pisane, dostupne su i video upute koje prate sve korake opisane u pisanim uputama. Pojedine kategorije video uputa su podijeljene na nekoliko manjih dijelova kako bi prikaz bio jednostavniji.
CARNET je za administratore e-Matice i razrednike pripremio i online tečajeve za samostalno učenje o korištenju e-Matice. Tečajevi su dostupni u sustavu Loomen (CARNET-ova Moodle platforma) na sljedećim poveznicama: