Od osnutka muzeja 1901. godine nalazi se u zgradi Hrvatskoga učiteljskog doma izgrađenog 1889. godine. Stalni postav muzeja otvoren je 2000. godine od kada su posjetiteljima s oko 1 000 eksponata predstavljene muzejske zbirke i prikazani počeci razvoja modernoga hrvatskog školstva. Broj posjetitelja od tada kontinuirano je rastao kao i broj sudionika muzejskih pedagoških radionica sve do zatvaranja muzeja za javnost 2020. godine kada je zgrada muzeja stradala u potresima. U suradnji s drugim muzejima i kulturnim ustanovama i online muzej aktivno nastavlja svoje predstavljanje hrvatskoj javnosti. Na blogu Hrvatskoga školskog muzeja nalazi se priča o povijesti jedinog školskog muzeja u Hrvatskoj Hrvatski školski muzej uz nadu kako će sljedeći rođendan bit proslavljen s posjetiteljima u obnovljenom prostoru muzeja na Trgu Republike Hrvatske 4.
